No que diz respeito ao alinhamento múltiplo de sequências, julgue os próximos itens.
Os métodos progressivos de alinhamento múltiplo de n sequências possibilitam calcular, na última fase, o alinhamento de todos os possíveis pares de sequências.
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O HMMER usa modelos coloridos de Markov para alinhar uma sequência de aminoácidos com um determinado perfil (profile).
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O CLUSTALW é uma das ferramentas heurísticas mais comuns para alinhamento múltiplo de sequências.
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O alinhamento múltiplo de sequências é bastante utilizado para obtenção das estruturas terciárias das proteínas que compõem o mesmo.
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O alinhamento múltiplo de sequências consiste no alinhamento de mais de duas sequências.
Quanto à comparação de sequências biológicas, julgue os seguintes itens.
O BLAST é um conjunto de programas que podem ser executados via sítio do NCBI.
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O programa ssearch permite implementar uma variação do BLAST.
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O BLAST é executado em duas grandes fases: semeadura (seeding) e extensão.
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O algoritmo de Smith-Waterman permite encontrar o alinhamento ótimo entre duas sequências, porém, devido à sua complexidade exponencial de tempo, sua execução é muito demorada.
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O objetivo principal da comparação de sequências biológicas é encontrar o(s) alinhamento(s) de maior escore de similaridade.
