Considerando o alinhamento de uma sequência nucleotídica desconhecida em relação a um banco de dados de genes associados ao câncer, julgue os itens seguintes.

O programa BLASTp permite a comparação de uma sequência de aminoácidos com todas as proteínas de cada sequência de aminoácido possível, calculada a partir de cada sequência de nucleotídeos depositada no banco, nos 6 quadros de leitura, além das sequências depositadas diretamente como string (sequência) de aminoácidos.

Considerando o alinhamento de uma sequência nucleotídica desconhecida em relação a um banco de dados de genes associados ao câncer, julgue os itens seguintes.

A matriz de penalidade BLOSUM62 considera os blocos de sequência com, no máximo, 62% de identidade.

Acerca de sequências de macromoléculas aplicadas ao câncer, julgue os itens a seguir.

O formato FASTA de sequências nucleotídicas é sempre mostrado em letras minúsculas.

Acerca de sequências de macromoléculas aplicadas ao câncer, julgue os itens a seguir.

O formato de sequências FASTA obedece a um padrão que é definido por uma linha que se inicia pelo símbolo >, que determina uma definição curta sobre a sequência.

No que diz respeito ao alinhamento múltiplo de sequências, julgue os próximos itens.

Os métodos progressivos de alinhamento múltiplo de n sequências possibilitam calcular, na última fase, o alinhamento de todos os possíveis pares de sequências.

No que diz respeito ao alinhamento múltiplo de sequências, julgue os próximos itens.

O HMMER usa modelos coloridos de Markov para alinhar uma sequência de aminoácidos com um determinado perfil (profile).

No que diz respeito ao alinhamento múltiplo de sequências, julgue os próximos itens.

O CLUSTALW é uma das ferramentas heurísticas mais comuns para alinhamento múltiplo de sequências.

No que diz respeito ao alinhamento múltiplo de sequências, julgue os próximos itens.

O alinhamento múltiplo de sequências é bastante utilizado para obtenção das estruturas terciárias das proteínas que compõem o mesmo.

No que diz respeito ao alinhamento múltiplo de sequências, julgue os próximos itens.

O alinhamento múltiplo de sequências consiste no alinhamento de mais de duas sequências.

Quanto à comparação de sequências biológicas, julgue os seguintes itens.

O BLAST é um conjunto de programas que podem ser executados via sítio do NCBI.