Banca:
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Durante uma análise proteômica, foi realizada a clivagem proteolítica de um componente e os produtos dessa clivagem tiveram suas massas moleculares determinadas por espectrometria de massa. As massas resultantes foram utilizadas como parâmetros em uma ferramenta de bioinformática, como mostra a figura acima. Considerando tais informações, julgue os itens que se seguem.
O campo Allow up to 1 missed cleavages é utilizado para permitir que a clivagem teórica seja realizada de forma inespecífica em 1 resíduo de cada seqüência.
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Durante uma análise proteômica, foi realizada a clivagem proteolítica de um componente e os produtos dessa clivagem tiveram suas massas moleculares determinadas por espectrometria de massa. As massas resultantes foram utilizadas como parâmetros em uma ferramenta de bioinformática, como mostra a figura acima. Considerando tais informações, julgue os itens que se seguem.
A especificação do agente de clivagem proteolítica é utilizada pelo programa para a realização de clivagens teóricas nas seqüências depositadas no banco de dados.
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Durante uma análise proteômica, foi realizada a clivagem proteolítica de um componente e os produtos dessa clivagem tiveram suas massas moleculares determinadas por espectrometria de massa. As massas resultantes foram utilizadas como parâmetros em uma ferramenta de bioinformática, como mostra a figura acima. Considerando tais informações, julgue os itens que se seguem.
O campo onde devem ser digitadas as massas resultantes referidas no texto está identificado na tela mostrada por Query.
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Durante uma análise proteômica, foi realizada a clivagem proteolítica de um componente e os produtos dessa clivagem tiveram suas massas moleculares determinadas por espectrometria de massa. As massas resultantes foram utilizadas como parâmetros em uma ferramenta de bioinformática, como mostra a figura acima. Considerando tais informações, julgue os itens que se seguem.
Se for selecionado o campo Average na tela mostrada, devese calcular a média das massas dos peptídios obtidas experimentalmente para se submeter à busca.
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Durante uma análise proteômica, foi realizada a clivagem proteolítica de um componente e os produtos dessa clivagem tiveram suas massas moleculares determinadas por espectrometria de massa. As massas resultantes foram utilizadas como parâmetros em uma ferramenta de bioinformática, como mostra a figura acima. Considerando tais informações, julgue os itens que se seguem.
Ao se aumentar para 15 Da a tolerância para a massa dos peptídios, aumenta-se a probabilidade de se encontrar uma proteína no banco de dados cujas massas dos peptídios coincidam aleatoriamente com as massas experimentais.
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Durante uma análise proteômica, foi realizada a clivagem proteolítica de um componente e os produtos dessa clivagem tiveram suas massas moleculares determinadas por espectrometria de massa. As massas resultantes foram utilizadas como parâmetros em uma ferramenta de bioinformática, como mostra a figura acima. Considerando tais informações, julgue os itens que se seguem.
No campo relativo a modificações variáveis (Variable modifications), deve-se marcar as modificações que não ocorrem de forma sistemática em todos os resíduos passíveis da modificação.
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Em um estudo sobre determinada via metabólica de mamíferos, foi isolada uma proteína, chamada proteína Z, aparentemente envolvida no mecanismo de regulação dessa via. A proteína foi purificada em diversas etapas cromatográficas, cujas frações foram coletadas e posteriormente analisadas pelas espectrometrias de massa dos tipos dessorção a laser auxiliada por matriz — matrix assisted laser desorption ionization (MALDI) — e eletronebulização — electrospray ionization (ESI). A proteína Z teve sua estrutura primária determinada por um método químico e passou a ser expressa em microrganismos pelo uso de técnicas de engenharia genética. As figuras acima mostram um cromatograma de uma ...
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Em um estudo sobre determinada via metabólica de mamíferos, foi isolada uma proteína, chamada proteína Z, aparentemente envolvida no mecanismo de regulação dessa via. A proteína foi purificada em diversas etapas cromatográficas, cujas frações foram coletadas e posteriormente analisadas pelas espectrometrias de massa dos tipos dessorção a laser auxiliada por matriz — matrix assisted laser desorption ionization (MALDI) — e eletronebulização — electrospray ionization (ESI). A proteína Z teve sua estrutura primária determinada por um método químico e passou a ser expressa em microrganismos pelo uso de técnicas de engenharia genética. As figuras acima mostram um cromatograma de uma ...
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Em um estudo sobre determinada via metabólica de mamíferos, foi isolada uma proteína, chamada proteína Z, aparentemente envolvida no mecanismo de regulação dessa via. A proteína foi purificada em diversas etapas cromatográficas, cujas frações foram coletadas e posteriormente analisadas pelas espectrometrias de massa dos tipos dessorção a laser auxiliada por matriz — matrix assisted laser desorption ionization (MALDI) — e eletronebulização — electrospray ionization (ESI). A proteína Z teve sua estrutura primária determinada por um método químico e passou a ser expressa em microrganismos pelo uso de técnicas de engenharia genética. As figuras acima mostram um cromatograma de uma ...