Em aquaponia, o ciclo de nitrogênio é um processo contín

A A amônia presente nos tanques de aquaponia atraem Nitrosomonas, um tipo de bactéria nitrificante que povoarão o sistema, convertendo amônia (NH₃) em nitrito (NO₂), sendo benéfico para os peixes e plantas.
B Após detectar nitritos (NO₂) na água numa concentração superior a 0,02 mg/L e as concentrações de amônia (NH₃) e nitrato (NO₃) caírem para 0,5 ppm, ou menos, o sistema estará totalmente ciclado e a aquaponia começará oficialmente. 
C Após a instalação do sistema, e adicionados os peixes, as plantas e a água, a aquaponia será iniciada. 
D A amônia é tóxica para os peixes e os matará rapidamente, a menos que seja convertido em uma forma menos tóxica de nitrogênio. 
E O nitrogênio encontrado na amônia é prontamente absorvido pelas plantas, não afetando a nutrição dos peixes.