Os préfets [...] ainda existem atualmente, e eram encarre...

A

A frase acolhe fatos que se dão em distintas dimensões temporais, dispondo-os em ordem cronológica.

B

A preposição até expressa um limite posterior de tempo, como em "Ele ficará no cargo até encontrar um substituto competente".

C

A presença da vírgula aposta a atualmente é obrigatória, pois o padrão culto escrito não legitima nenhuma outra possibilidade de pontuação da frase, como, por exemplo, a presença somente do ponto final.

D

A substituição de atualmente por "na contemporaniedade" não afetaria a correção da frase.

E

No contexto, a palavra ainda demarca excesso temporal.