Sobre as configurações e ajustes do microscópio...

A O pinhole no plano de imagem deve ser ajustado para o maior diâmetro possível, a fim de maximizar a quantidade de luz coletada. B A resolução axial (profundidade) do microscópio confocal é independente do tamanho do pinhole. C A resolução lateral do microscópio confocal é determinada apenas pelo comprimento de onda da luz, sem influência do pinhole. D O microscópio confocal não requer alinhamento óptico preciso, pois o sistema de detecção é autoajustável.  E O uso de um pinhole pequeno melhora a resolução axial, mas reduz a intensidade do sinal detectado.