A supressão da vírgula altera o sentido da frase em:

A Nos primeiros milênios de sua história, o homo sapiens começava a interferir na vida do planeta.  B O autor mostra sua desconfiança quanto aos deuses irresponsáveis, que se sentem insatisfeitos. C Não se leve tão em conta o louvor ao progresso, já que nem todos são tocados por ele. D Mesmo nos impérios e nas grandes conquistas, a miséria não deixou de marcar presença. E Houve ciclos de aumento na capacidade humana, mas não necessariamente em favor de todos.