Em relação às técnicas “ômicas”, julgue o item seguinte. 

Estudos de genômica comparativa em plantas revelam que, dentro de uma espécie, enquanto os genes codificadores de proteínas são estritamente conservados, observa-se uma divergência evidente em termos de variantes estruturais nos genomas, fundamental para a determinação de características fenotípicas de interesse para a produção agrícola. 

O processo de anotação genômica requer o uso de fundamentos de biologia e diversas ferramentas para auxiliar o processo. A esse respeito, julgue o item a seguir.

Na anotação genômica, é fundamental o estabelecimento de relações evolutivas e funcionais com espécies afins, e a busca por ortólogos é central para os esforços de transferência de anotação funcional, o que pode ser feito por meio de buscas em bancos de dados curados com grupos de genes ortólogos, como o KEGG. 

O processo de anotação genômica requer o uso de fundamentos de biologia e diversas ferramentas para auxiliar o processo. A esse respeito, julgue o item a seguir.

O alinhamento de duas sequências biológicas é um exemplo clássico de  utilização da programação dinâmica, especificamente para contemplar os diferentes tipos de alfabetos de caracteres no DNA e nas proteínas. 

O processo de anotação genômica requer o uso de fundamentos de biologia e diversas ferramentas para auxiliar o processo. A esse respeito, julgue o item a seguir.

As matrizes de substituição são fundamentais para a realização de alinhamentos de sequências biológicas, e as variantes BLOSUM e PAM são o padrão em programas como o CLUSTAL W e BLAST, visto que elas modulam a taxa de substituição entre os aminoácidos e nucleotídeos que fornecem escores para as lacunas (gaps). 

O processo de anotação genômica requer o uso de fundamentos de biologia e diversas ferramentas para auxiliar o processo. A esse respeito, julgue o item a seguir.

Os programas de alinhamento múltiplo de sequências, como o MUSCLE, CLUSTAL W e MAFFT, fazem uso da estratégia de alinhamento progressivo,em que uma árvore-guia é gerada a partir de todas as combinações de alinhamentos par-a-par, e, posteriormente, alinham-se as duas mais similares de acordo com a pontuação fornecida por uma matriz de substituição selecionável pelo usuário. 

No que se refere a métodos heurísticos e à modelagem comparativa por homologia, julgue o seguinte item. 

A modelagem dos dados por meio do algoritmo índex overlay pode ser utilizada por metodologia heurística para mapeamento cartográfico, classificando-se maior ou menor susceptibilidade de riscos. 

No que se refere a métodos heurísticos e à modelagem comparativa por homologia, julgue o seguinte item. 

A modelagem molecular consiste no estudo da geometria e das propriedades das moléculas por meio de técnicas computacionais para a elucidação de interações intra/intermoleculares, mecanismos de reações químicas e estrutura e função de proteínas difíceis de serem purificadas em grande escala, e, para a construção do modelo de uma proteína, utilizam-se padrões de geometria de átomos e de ligações químicas (especialmente tamanho e ângulos). 

No que se refere a métodos heurísticos e à modelagem comparativa por homologia, julgue o seguinte item. 

A utilização de uma busca heurística é uma alternativa à busca exaustiva, pois, nesta, se o número de características for muito grande, a busca será muito custosa computacionalmente, pois existem n subconjuntos para n características. 

No que se refere a métodos heurísticos e à modelagem comparativa por homologia, julgue o seguinte item. 

Na área de genética e biologia molecular, com ênfase em bioinformática, a análise de dados em sistemas de informação biológicos e os bancos de dados biológicos são ferramentas de análise e comparação de genomas, probabilidade e estatística aplicada ao melhoramento animal e à experimentação agropecuária, não tendo, porém, eficácia na geração de marcadores moleculares. 

No que se refere a métodos heurísticos e à modelagem comparativa por homologia, julgue o seguinte item. 

A bioinformática trata do manuseio de dados genômicos, seja para tratamento da estrutura e do armazenamento dos dados, seja para a análise e geração de conhecimento em processos automáticos ou semiautomatizados.