Os processos de nitrificação e desnitrificação podem ser desenvolvidos de forma integrada ao processo de lodos ativados, mas requerem uma sequência e condições adequadas de operação. Para que a nitrificação e desnitrificação possam ocorrer de forma eficiente é necessário
que seja utilizado um processo anaeróbio antes do reator biológico, que deve ser mantido em condições anóxicas para que o nitrogênio orgânico seja reduzido.
a utilização de um sistema aeróbio de tratamento, onde o nitrogênio orgânico é oxidado para as formas amoniacal e nitrogênio molecular, seguido de um sistema anaeróbio.
um sistema anóxico, para a redução de nitrato a nitrogênio molecular, seguido de um sistema aeróbio, com recirculação da maior parte do efluente para o sistema anóxico.
um sistema de clarificação quimicamente assistido, para a remoção do nitrogênio amoniacal, seguido de um processo de lodos ativados com aeração prolongada.
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