O processo de anotação genômica requer o uso de fundamentos de biologia e diversas ferramentas para auxiliar o processo. A esse respeito, julgue o item a seguir.

Na anotação genômica, é fundamental o estabelecimento de relações evolutivas e funcionais com espécies afins, e a busca por ortólogos é central para os esforços de transferência de anotação funcional, o que pode ser feito por meio de buscas em bancos de dados curados com grupos de genes ortólogos, como o KEGG. 

O processo de anotação genômica requer o uso de fundamentos de biologia e diversas ferramentas para auxiliar o processo. A esse respeito, julgue o item a seguir.

O alinhamento de duas sequências biológicas é um exemplo clássico de  utilização da programação dinâmica, especificamente para contemplar os diferentes tipos de alfabetos de caracteres no DNA e nas proteínas. 

O processo de anotação genômica requer o uso de fundamentos de biologia e diversas ferramentas para auxiliar o processo. A esse respeito, julgue o item a seguir.

As matrizes de substituição são fundamentais para a realização de alinhamentos de sequências biológicas, e as variantes BLOSUM e PAM são o padrão em programas como o CLUSTAL W e BLAST, visto que elas modulam a taxa de substituição entre os aminoácidos e nucleotídeos que fornecem escores para as lacunas (gaps). 

No que se refere a métodos heurísticos e à modelagem comparativa por homologia, julgue o seguinte item. 

Na área de genética e biologia molecular, com ênfase em bioinformática, a análise de dados em sistemas de informação biológicos e os bancos de dados biológicos são ferramentas de análise e comparação de genomas, probabilidade e estatística aplicada ao melhoramento animal e à experimentação agropecuária, não tendo, porém, eficácia na geração de marcadores moleculares. 

No que se refere a métodos heurísticos e à modelagem comparativa por homologia, julgue o seguinte item. 

A bioinformática trata do manuseio de dados genômicos, seja para tratamento da estrutura e do armazenamento dos dados, seja para a análise e geração de conhecimento em processos automáticos ou semiautomatizados.  

A respeito de predição de estrutura de proteínas, de redes de computadores e Internet, de técnicas de análise de expressão gênica em escala, de técnicas de sequenciamento de DNA em escala e de visualização e manipulação de estruturas de macromoléculas biológicas, julgue o item seguinte. 

Ferramentas de IA, como o AlphaFold, permitem predições de estrutura de proteínas. 

A respeito de predição de estrutura de proteínas, de redes de computadores e Internet, de técnicas de análise de expressão gênica em escala, de técnicas de sequenciamento de DNA em escala e de visualização e manipulação de estruturas de macromoléculas biológicas, julgue o item seguinte. 

A identificação de genes de certa planta relacionados à resistência ou mesmo à suscetibilidade da planta a determinado patógeno pode ser realizada por meio do sequenciamento de alta profundidade do transcritoma da planta. 

A respeito de predição de estrutura de proteínas, de redes de computadores e Internet, de técnicas de análise de expressão gênica em escala, de técnicas de sequenciamento de DNA em escala e de visualização e manipulação de estruturas de macromoléculas biológicas, julgue o item seguinte. 

Com os avanços no campo da biotecnologia, simulações de processos em escala de bancada são necessárias para a geração de parâmetros a serem adotados em operação de plantas de produção em grande escala. 

A respeito de predição de estrutura de proteínas, de redes de computadores e Internet, de técnicas de análise de expressão gênica em escala, de técnicas de sequenciamento de DNA em escala e de visualização e manipulação de estruturas de macromoléculas biológicas, julgue o item seguinte. 

No sequenciamento de DNA com grande quantidade de sequências repetitivas, genomas comparativos, polimorfismos e genes diferencialmente expressos são atualmente muito estudados por meio de microchips de DNA, também conhecidos como microarranjos, sequenciamento por síntese. 

Julgue o próximo item, referente a técnicas de sequenciamento de DNA em escala e visualização e manipulação de estruturas de macromoléculas biológicas. 

Dados gerados pelas tecnologias de sequenciamento de alto rendimento, também conhecidos como dados multiômicos, permitem a extração de informações genômicas, transcriptômicas e proteômicas em grande escala, de forma rápida, confiável e a baixo custo.