Com o advento do sequenciamento de ácidos nucleicos em larga escala, tornou-se possível realizar a comparação de organismos em termos de suas sequências de DNA e das proteínas codificadas por essas sequências. No que diz respeito ao alinhamento de sequências, julgue os itens a seguir. A matriz de regiões coincidentes entre duas sequências busca o alinhamento com menor similaridade calculada pelos algoritmos de programação dinâmica.

Tendo em vista que a bioinformática possui estreita relação com o sistema operacional Linux, softwares livres e dependência de hardwares específicos para viabilizar as análises, julgue os itens de 91 a 95, relativos ao desenvolvimento de software na bioinformática. O modelo de computação em nuvem representa uma alternativa para redução de custos de implantação e manutenção de um laboratório de bioinformática, pois provê uma infraestrutura remota de virtualização de software e de hardware que permite o armazenamento e a análise de dados, baseado no sistema operacional Hadoop e no modelo de programação MapReduce.

Tendo em vista que a bioinformática possui estreita relação com o sistema operacional Linux, softwares livres e dependência de hardwares específicos para viabilizar as análises, julgue os itens de 91 a 95, relativos ao desenvolvimento de software na bioinformática. Muitos servidores empregam o arranjo redundante de discos independentes (RAID), uma solução de virtualização de armazenamento que fornece ganhos de desempenho e de redundância. Nesse sentido, RAID 0 corresponde ao nível que oferece maior redundância e maior desempenho.

Tendo em vista que a bioinformática possui estreita relação com o sistema operacional Linux, softwares livres e dependência de hardwares específicos para viabilizar as análises, julgue os itens de 91 a 95, relativos ao desenvolvimento de software na bioinformática. Linguagens de programação compiladas, como C e FORTRAN, são direcionadas a aplicações que requerem alto desempenho de processamento, enquanto linguagens interpretadas, como PERL e Python, são utilizadas na maioria dos casos devido ao menor tempo de desenvolvimento e à necessidade de menos linhas de código-fonte.

Tendo em vista que a bioinformática possui estreita relação com o sistema operacional Linux, softwares livres e dependência de hardwares específicos para viabilizar as análises, julgue os itens de 91 a 95, relativos ao desenvolvimento de software na bioinformática. O Linux, sistema operacional da família Unix, é amplamente utilizado na bioinformática por ser livre e possuir uma distribuição oficial centralizada.

Na década de 70 do século passado, o cientista Carl Woese revolucionou o meio científico ao utilizar a sequência do RNA ribossômico (rRNA) para classificar os organismos. Com esse uso pioneiro da filogenia molecular, surgiu a classificação dos organismos em três domínios: eucariotos, bactérias e arquea. Considerando esse assunto, julgue os próximos itens, referentes ao papel da bioinformática no estudo da evolução de genes e de organismos. A metagenômica estuda as comunidades microbianas nos seus ambientes naturais. Técnicas de NGS são utilizadas para sequenciar regiões do gene de rRNA 16S. Computacionalmente, mesmo sequências que apresentem diferenças de até 3% das bases podem ser consideradas provenientes da mesma espécie.

Na década de 70 do século passado, o cientista Carl Woese revolucionou o meio científico ao utilizar a sequência do RNA ribossômico (rRNA) para classificar os organismos. Com esse uso pioneiro da filogenia molecular, surgiu a classificação dos organismos em três domínios: eucariotos, bactérias e arquea. Considerando esse assunto, julgue os próximos itens, referentes ao papel da bioinformática no estudo da evolução de genes e de organismos. A construção de árvores filogenéticas, que se baseia em sequências moleculares de proteínas ou de nucleotídeos, utiliza metodologias como máxima verossimilhança, máxima parcimônia e inferência bayesiana para fornecer representações exatas da taxonomia de um grupo de organismos.

Na década de 70 do século passado, o cientista Carl Woese revolucionou o meio científico ao utilizar a sequência do RNA ribossômico (rRNA) para classificar os organismos. Com esse uso pioneiro da filogenia molecular, surgiu a classificação dos organismos em três domínios: eucariotos, bactérias e arquea. Considerando esse assunto, julgue os próximos itens, referentes ao papel da bioinformática no estudo da evolução de genes e de organismos. O uso de sequências moleculares para estudos evolutivos requer como entrada um alinhamento múltiplo de sequências gerado por programas como Clustalw e Muscle.

O prêmio Nobel de Química de 2013 foi concedido a cientistas pioneiros da bioinformática estrutural, que desenvolveram modelos computacionais para a simulação de dinâmica de proteínas. Acerca da bioinformática estrutural, julgue os itens que se seguem. Com os avanços da simulação computacional, foi solucionado o problema da predição da estrutura tridimensional de proteínas a partir de sua estrutura primária, eliminando-se a lacuna, criada pela genômica, de milhões de sequências disponíveis em bancos de dados sem informação estrutural.

O prêmio Nobel de Química de 2013 foi concedido a cientistas pioneiros da bioinformática estrutural, que desenvolveram modelos computacionais para a simulação de dinâmica de proteínas. Acerca da bioinformática estrutural, julgue os itens que se seguem. Na dinâmica molecular, aproximações baseadas em modelos da física clássica são utilizadas para simular o movimento coordenado dos átomos e, com isso, capturar as flutuações conformacionais de moléculas, incluindo proteínas e ácidos nucleicos.