Entre os fatores limnológicos que são alterados logo após o fechamento das barragens, e que eventualmente acabam por alterar a distribuição de espécies ao longo dos rios, inclui-se
a transformação do ambiente lêntico para lótico ou semilótico.
a intensificação da estratificação química, com diminuição da qualidade da água, especialmente no fundo do rio.
a diminuição da estratificação térmica, levando a homogeneização da coluna térmica.
o decréscimo gradual da riqueza local de espécies da ictiofauna.
a floração de algas.
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