O IVA pode ser calculado por diferentes métodos. No métod

A pela aplicação da alíquota sobre o valor adicionado obtido a partir da soma de todos os pagamentos a fatores de produção, inclusive os lucros.
B a partir do total de vendas, deduzido pelo total de compras, em cada estágio do processo produtivo. 
C pela aplicação da alíquota sobre o total de vendas, reduzindo desse resultado a alíquota sobre o total das compras.
D diretamente pela Receita Federal do Brasil, que é a responsável única pela fiscalização ao direito ao uso do crédito fiscal.
E pela aplicação da alíquota diretamente sobre o faturamento de cada empresa.