Ainda com relação ao ácido peracético, as formulações comerciais são associadas com o peróxido de hidrogênio que tem como mecanismo de ação:
A produção de radicais livres de hidroxil, os quais atacam os lipídeos de membranas, o DNA e outros componentes celulares.
A desnaturação de proteínas, alteração da parede celular, oxidação de ligações sulfidrilas e sulfúricas de proteínas.
A alquilação de grupos sulfidrilas e amino de proteínas e do anel contendo nitrogênio das bases purínicas.
A inativação de enzimas produtoras de energia, desnaturação de proteínas celulares essenciais e metilação de polipetídeos.
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