Para a escolha de áreas prioritárias para a proteção de populações e comunidades, são adotados critérios que se baseiam na presença de espécies mais vulneráveis à extinção local. Um destes critérios é a:
ocorrência de grande número de espécies exóticas;
presença de espécies ruderais e de uso direto;
presença de comunidades monodominantes e monoestratificadas;
ocorrência de espécies endêmicas, raras;
ocorrência de espécies invasoras e de uso direto.
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