Software de análise ômica, como Cytoscape, String,...

A String é um software usado exclusivamente para análise de expressão gênica diferencial, permitindo comparar a abundância de transcritos entre diferentes condições experimentais. B KEGG é um software de visualização de redes biológicas que permite prever interações entre proteínas com base em coexpressão gênica e experimentos de ligação molecular. C Cytoscape permite identificar exclusivamente proteínas que participam de vias metabólicas, mas não é útil para a análise de redes de interação gênica. D Reactome oferece análise de enriquecimento funcional, mas sua base de dados não é atualizada periodicamente, dificultando a integração com dados ômicos recentes.  E ClueGO é um plugin do Cytoscape que permite a análise integrada de enriquecimento funcional, combinando termos de Gene Ontology (GO) e vias de KEGG, ajudando a interpretar redes de interações moleculares.