Existem diferentes metodologias que o zootecnista pode util

A Indicadores indigestíveis como óxido de cromo (Cr₂O₃), óxido de titânio (TiO₂) e cinza ácida insolúvel são utilizados no método de coleta parcial de fezes ou excreta.
B O método de coleta de conteúdo ileal é tradicionalmente o mais utilizado para determinar a digestibilidade de nutrientes em cães e peixes.
C O óxido de ferro (Fe₂O₃, vermelho) é utilizado como indicador no método de coleta de conteúdo ileal, servindo para determinar o fator de indigestibilidade. 
D O método de coleta parcial de excretas ou fezes é utilizado para determinar a energia bruta dos alimentos para animais não ruminantes.
E A coleta de conteúdo ileal em aves e suínos é utilizada para determinar a energia metabolizável verdadeira dos alimentos.